באתר של הספרייה הלאומית בארה"ב ישנו דף ובו עשרות קישורים למגוון גדול של מדריכים שקשורים לשימוש במאגר הביורפואי Pubmed כולל שימוש ב-MESH , שימוש ב- My NCBI, ושימוש ב- LinkOut – גם לספרנים וגם למולים . המדריכים כוללים בין היתר גם כיצד לחפש מידע על רפואה מבוססת ראיות ב- Pubmed , מידע על מחלות, מידע תרופתי , מגוון סינונים על פי שדות ועוד.המדריכים הם במגוון פורמטים: PDF , קובצי וידאו ומצגות.
ועוד בהקשר לשימוש ב- Pubmed כדאי להכיר את הכלי Mesh on demand כלי זה מאפשר למשתמש שאינו בקי במונחי ה- MESH להזין טקסט של עד 10000 תווים . המערכת מנתחת את הטקסט בעזרת התוכנה NLM Medical Text Indexer (MTI) ומציגה מונחי MESH רלוונטיים לטקסט שהוזן. מידע נוסף על כלי זה אפשר למצוא ב- NLM Technical Bulletin .